Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms