Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MCMBPQ9BTE3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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