Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms