Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRIQ1Q96JM4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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