Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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UBXN4Q92575 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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UBXN4Q92575 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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UBXN4Q92575 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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UBXN4Q92575 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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