Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms