Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms