Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms