Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms