Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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