Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGSM1Q2NKQ1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms