Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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