Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms