Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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