Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms