Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms