Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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