Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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