Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CBX3Q13185 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CBX3Q13185 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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