Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFT88Q13099 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT88Q13099 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT88Q13099 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
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IFT88Q13099 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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IFT88Q13099 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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IFT88Q13099 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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IFT88Q13099 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT88Q13099 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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IFT88Q13099 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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IFT88Q13099 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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