Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms