Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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