Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms