Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms