Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms