Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms