Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC108471.2-205ENST00000529314 628 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC092718.2-203ENST00000561808 789 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TNMD-201ENST00000373031 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RFPL3S-203ENST00000400234 1295 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RN7SKP169-201ENST00000411124 291 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 OR13D2P-201ENST00000430667 907 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LINC00674-201ENST00000435469 678 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms