Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms