Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms