Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTHL1P78549 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NTHL1P78549 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NTHL1P78549 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms