Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TBX4P57082 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TBX4P57082 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TBX4P57082 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms