Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBP50607 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBP50607 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBP50607 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBP50607 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms