Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATMP50440 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATMP50440 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATMP50440 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms