Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DCUN1D2-AS-201ENST00000414992 330 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms