Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI2P48788 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms