Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP8P40818 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP8P40818 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP8P40818 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms