Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms