Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms