Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFE3P19532 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms