Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms