Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms