Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3O43889 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms