Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms