Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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