Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HELTA6NFD8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms