Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms