Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX10Q9Y5X0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX10Q9Y5X0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms