Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP3Q9Y446 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP3Q9Y446 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms