Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHTOPQ9Y3Y2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms