Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A6Q9Y2P4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms